1852年10月9日，埃米尔·费歇尔出生于德国莱茵河附近的乌斯吉城，他的父亲劳伦兹·费歇尔是当地富有的企业家。埃米尔自幼勤奋好学，1869年以全班第一名的成绩毕业于波恩大学预科，1871年进入波恩大学，一年以后，又转入斯特拉斯堡大学学习，该校对于新入学的化学系学生要求很严，规定必须经过严格的无机化学和分析化学的训练。在德国化学家H．罗斯指导下，E．费歇尔熟练地掌握了用本生创造的分析方法来分析水质。接着，E．费歇尔开始学习有机化学，很幸运的是，他开始与拜教授接触。拜耳很快就发现了这位勤奋好学的青年的才能，并精心地加以培养。
　　1874年E．费歇尔在拜耳教授指导下，完成了论文《有色物质的荧光和苔黑素》获得哲学博士学位，成为该校有史以来最年轻的博士。E．费歇尔毕业以后，当时已受聘担任慕尼黑大学化学教授的拜耳希望E．费歇尔能和他一起在慕尼黑大学任教。能够在这位有机化学权威指导下学习和研究，恰恰是E·费歇尔的愿望，于是E．费歇尔欣然当了拜耳的助教。
　　19世纪的有机化学大师，对糖、酶、嘌呤、氨基酸和蛋白质进行了广泛深入的研究。1902年获诺贝尔化学奖。在著名的威廉皇帝学会的创立中，费歇尔也起了重要的作用。
　　19世纪下半叶和20世纪之初，在有机化学领域中，德国的费歇尔是最知名的学者之一。他发现了苯肼，对糖类、嘌呤类有机化合物的研究取得了突出的成就，因而荣获1902年的诺贝尔化学奖。

科学发展的贡献
　　一、对糖类的研究；
　　二、对嘌呤类化合物的研究；
　　三、对蛋白质；主要是氨基酸、多肽的研究；
　　四、在化工生产和化学教育上的贡献。
　　由此可见，他的研究领域集中在对有机化学中那些与人类生活、生命有密切关系的有机物质的探索。可以说他是生物化学的创始人。
　　“生命是蛋白体的存在方式”。用现代的观点来看，“蛋白体”实际上就是蛋白质和核酸的复合体。鉴于这一点，可见费歇尔研究工作的重要意义，他为现代蛋自质和核酸的研究奠定了一个重要的基础。

以费歇尔命名的贡献
　　费歇尔吲哚合成
　　费歇尔投影式
　　费歇尔恶唑合成
　　费歇尔肽合成